Über viele Jahre war er Dekan der Medizinischen Fakultät, mehrfach Dekan der Philosophischen Fakultät und Prorektor der Universität. Außerdem war er seit 1696 Mitglied der Leopoldina und wurde 1701 Mitglied der Königlich-Preußischen Akademie der Wissenschaften, 1720 Mitglied der Royal Society und 1734 Ehrenmitglied der Russischen Akademie der Wissenschaften. Nachdem er Friedrich Wilhelm I. von Preußen bei einer Krankheit helfen konnte, wurde er zum Geheimrat ernannt. Im hohen Alter von 82 Jahren verstarb er in Halle.

Warum nehmen wir ihn in unsere ausgewählte Gesellschaft der Pioniere der Weinkultur auf?
Hoffmann sah den Organismus als eine Art hydraulische Maschine an: Der Spannungszustand (Tonus) der Fasern und damit alle das Leben charakterisierenden Bewegungsvorgänge werden gesteuert von einem Nervenfluidum. Alle physiologischen Funktionen waren für ihn abhängig von der Bewegungsintensität des Blutes und des Nervensaftes in einem intakten Gefäßsystem. Im Umkehrschluss sah er Störungen dieses Systems als Ursache für die Entstehung von Krankheiten. Dieser Theorie entsprechend wandte Hoffmann Heilmittel an, die die Verdauung und die Ausscheidungen fördern und hierdurch die stoffliche Zusammensetzung von Blut und Nervensaft verbessern sollten. Dazu passte:

„Ein guter Wein, mäßig genossen, befördert in vorzüglicher Weise die Verdauung.“

Diese medizinische Blut- und Nervensaft-Bewegungslehre wurde auch zur Grundlage der bekannten Weinärzte des 19. Jahrhunderts (Karl Graff, Franz Meurer, Jodocus Reis). Meurer zitierte Hoffmanns Kriterien für einen gesunden Wein: „Der Wein sei nicht zu geistreich, und nicht zu sauer, sondern gemäßigt, damit er durch den starken Geist den Kopf nicht angreife, und durch die Säure den Magen nicht belästige; und die Urinabsonderung und Hautausdünstung befördere“.

In Umsetzung seiner Theorie verordnete Hoffmann unter anderem den von ihm selbst kreierten Liquor anodynus mineralis - bis zum heutigen Tage bekannt als Hoffmannstropfen ­­- und Weine, insbesondere auch Rhein- und Moselweine. Moselweine verordnete er bei Gichterkrankungen. Er machte den Rheinwein nicht nur am preußischen Hofe populär, sondern er propagierte eine spezielle Kur mit Rheinweinen. Sie erstreckte sich über volle fünf Wochen, begann mit einer Dosis von 1,6 Litern täglich, nur leicht mit Wasser vermischt, und soll bei acht Litern pro Tag geendet haben. Aber vielleicht darf man diese Obergrenze ebenso wenig ernst nehmen wie die berühmte Frage an Radio Iriwan: „Kann man von Hoffmanns Tropfen Kinder kriegen?“ Antwort: Im Prinzip ja, kommt darauf an, (…)“. Denn laut Meurer vertrat Friedrich Hoffmann die Auffassung, dass Wein mit reinem Wasser gemischt, nach Art der Griechen, der Gesundheit zuträglicher sei, als purer Wein.